养殖区内定期打扫卫生，保持清洁，并用消毒药液喷洒消毒，以杀死各种病原体。常用的消毒药液有季胺盐类、含碘类等制剂，要定期更换消毒药物。

饲养期间每月可用广谱抗生素如阿莫西林、土霉素、环丙杀星等或用中草药拌料投饲3天，用来预防禽病的发生。

种鹅每年3月初肌肉注射小鹅瘟血清与鹅副黏病毒疫苗各1次。

常见疾病的预防黑天鹅的主要病害有小鹅瘟、大肠杆菌病、鹅副黏病毒病、禽霍乱、寄生虫病等，在做好常规工作的同时，要定期观察黑天鹅的精神状态，做到早发现、早隔离、早治疗，对症用药，以防禽病蔓延。

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